El molibdeno se puede utilizar en fertilizantes agrícolas.

Como componente de los fertilizantes con micronutrientes, el molibdeno desempeña un papel clave en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Promueve el metabolismo del nitrógeno en las plantas y participa en la formación de enzimas nitrogenadas, absorbiendo y utilizando así eficazmente el nitrógeno del suelo y ayudando a las plantas a prosperar. Además, el molibdeno interviene en la síntesis de proteínas, mejorando la estructura y función de las plantas. Al promover la síntesis de enzimas antioxidantes, el molibdeno también mejora la adaptabilidad de las plantas en ambientes adversos y aumenta la resistencia a la adversidad. La adición de molibdeno no sólo mejora el rendimiento y la calidad de los cultivos, sino que también ayuda a prevenir enfermedades de las plantas. Dado que el molibdeno es uno de los oligoelementos indispensables e insustituibles de las plantas, algunos fabricantes utilizan molibdato de amonio como oligoelemento que se añade a los fertilizantes para mejorar la resistencia de las plantas a la sequía, el frío y las enfermedades.